代替体检惩罚制度的是“健康促进制度”。健康促进制度是指通过促进健康生活方式、提高健康素养、加强健康管理等措施，激励和引导员工自觉关注健康、养成健康的生活习惯，提高身体素质和健康水平，从而达到预防疾病、提高工作效率、降低医疗费用等多重效益的目的。

健康促进制度主要包括以下方面：

1. 健康宣传教育：通过宣传健康知识、举办健康讲座、组织健康体检等形式，提高员工健康意识和健康素养。

2. 健康管理：建立健康档案，对员工的身体状况进行跟踪和管理，提供健康咨询和指导服务。

3. 健康奖励：通过设立健康奖励机制，激励员工积极参与健康促进活动，达到一定的健康目标可以获得相应的奖励。

4. 健康保险：提供健康保险，为员工提供医疗保障，减轻员工因疾病带来的负担。

健康促进制度的实施可以有效地改善员工的健康状况，提高工作效率和生产力，降低医疗费用和社会成本，同时也有利于企业形象的提升和员工的福利保障。因此，健康促进制度是一种更加人性化、科学化、有效的管理制度。