公司体检不能代替驾驶员体检。虽然公司体检和驾驶员体检都是为了保障员工身体健康，但是两者的检查内容和标准是不同的。

驾驶员体检是根据《道路运输车辆驾驶员从业资格证办法》的要求，针对驾驶员的身体状况、视力、听力、神经系统、心脏等方面进行检查，以确保驾驶员的身体状况符合从业资格证的要求，能够安全驾驶车辆。

而公司体检则是为了全面了解员工的身体状况，包括身高、体重、血压、血糖、血脂等指标的检查，以及常见疾病的筛查和预防。

因此，虽然公司体检可以帮助企业了解员工的身体状况，但是不能代替驾驶员体检，因为驾驶员体检是法律规定的必须检查项目，而且驾驶员的身体状况对于道路交通安全至关重要。